Laboratorium Mikroskopii Konfokalnej

Print Friendly, PDF & Email

Laboratorium
Mikroskopii Konfokalnej

Laboratorium ukierunkowane jest na świadczenie usług badawczych, dotyczących przede wszystkim analizy procesów biologicznych, zachodzących w żywych komórkach oraz tkankach, z wykorzystaniem mikroskopii jasnego pola i fluorescencji. Prowadzone prace koncentrują się na zmianach fizjologii komórkowej pod wpływem różnych czynników i mają na celu opracowanie nowych testów służących w diagnostyce i do badań substancji bio-aktywnych.


USŁUGI:

  • Wysokorozdzielcza analiza fluorescencyjna hodowli komórkowych i preparatów tkankowych morfometria, ocena wewnątrzkomórkowej dystrybucji wybranych struktur, rekonstrukcje 3D, badania ko-lokalizacji białek,
  • Przyżyciowa analiza mikroskopowa komórek i preparatów tkankowych w hodowli oraz in vivo morfologia i ruchliwość komórek oraz struktur wewnątrzkomórkowych w czasie rzeczywistym w świetle przechodzącym i techniką fluorescencji (kontrolowane warunki środowiska: temperatura, wilgotność, poziom CO2 i O2), analizy produkcji wolnych rodników za pomocą sondy CellROX Green
  • Analizy powierzchni materiałów za pomocą odbitego światła lasera
  • Mikroskopowe testy przesiewowe o charakterze wysokoprzepustowym (HTS – High Throughput Screening)
  • Analiza jakościowa i ilościowa obrazów mikroskopowych
  • Szkolenie z podstaw mikroskopii konfokalnej i analizy obrazów mikroskopowych

MIKROSKOP KONFOKALNY ZEISS CELL OBSERVER SD

  • Statyw odwrócony
  • Moduł spinning disk Yokogawa CSU-X1A 5000
  • Lasery: 405, 488, 561, 639 nm
  • Kamery EMCCD QImaging Rolera EM-C2 (Dual Camera)
  • Obiektywy: 10x (NA 0,30), 20x (NA 0,4 LD), 25x (NA 0,80 W), 40x (NA 0,6 LD; NA 1,20 W; NA 1,4 Oil), 63x (NA 1,20 W; NA 1,4 Oil), 100x (NA 1,46 Oil)
  • Zmotoryzowany stolik skaningowy z modułem Definite Focus
  • Inkubator XLmulti S1, wkładka grzewcza do płytek 96-dołkowych
  • Kontroler temperatury i stężeń O2, CO2
  • Moduł DirectFRAP do badań techniką FRAP (Fluorescence Recovery After Photobleaching – przywracanie fluorescencji po fotowygaszaniu)

MIKROSKOP KONFOKALNY ZEISS CELL OBSERVER SD


MIKROSKOP KONFOKALNY LEICA SP8 MP

  • Statyw prosty
  • Skaner konwencjonalny i rezonansowy (8 kHz)
  • Lasery VIS: 488, 552, 638 nm
  • Laser IR: Chameleon Vision II, pulsy femtosekundowe, długość fali regulowana w zakresie 680-1080 nm
  • Detektory: 3 wewnętrzne PMT, 4 zewnętrzne NDD-PMT
  • Obiektywy: 10x (NA 0,40), 20x (NA 0,75), 25x (NA 0,95 W), 40x (NA 1,10 W; NA 1,3 Oil), 63x (NA 1,4 Oil)
  • Zmotoryzowany stolik skaningowy
  • Kontroler temperatury i wkładka grzewcza do naczyń Petriego
  • Zestaw do przyżyciowego obrazowania myszy laboratoryjnych

MIKROSKOP KONFOKALNY LEICA SP8 MP


OPROGRAMOWANIE DO ANALIZY OBRAZÓW

  • Imaris 8 (Bitplane)
  • Huygens Professional (SVI)
  • Image-Pro Premier (Media Cybernetics)

 

dr Grzegorz Chodaczek – Kierownik laboratorium

mgr inż. Katarzyna Mikołajewicz – doktorantka

dr Monika Toporkiewicz – Inżynier Badań

dr Michał Majkowski – Inżynier Badań

  1. Motola M, Dworniczek E, Satrapinskyy L, Chodaczek G, Grzesiak J, Gregor M, Plecenik T, Nowicka J, Plesch G. UV light-induced photocatalytic, antimicrobial, and antibiofilm performance of anodic TiO2 nanotube layers prepared on titanium mesh and Ti sputtered on silicon. Chem. Pap. 2018. doi.org/10.1007/s11696-018-0667-4.
  2. Majkowski M, Laszkiewicz A, Sniezewski L, Grzmil P, Pawlicka B, Tomczyk I, Michniewicz M, Kapusniak V, Janik S, Chodaczek G, Cebrat M. Lack of NWC protein (c11orf74 homolog) in murine spermatogenesis results in reduced sperm competitiveness and impaired ability to fertilize egg cells in vitro. PLoS One. 2018 Dec 6;13(12):e0208649. doi.org/10.1371/journal.pone.0208649.
  3. Żywicka A, Junka AF, Szymczyk P, Chodaczek G, Grzesiak J, Sedghizadeh PP, Fijałkowski K. Bacterial cellulose yield increased over 500% by supplementation of medium with vegetable oil. Carbohydr Polym. 2018 Nov 1;199:294-303. doi.org/10.1016/j.carbpol.2018.06.126.
  4. Dydak K, Junka A, Szymczyk P, Chodaczek G, Toporkiewicz M, Fijałkowski K, Dudek B, Bartoszewicz M. Development and biological evaluation of Ti6Al7Nb scaffold implants coated with gentamycin-saturated bacterial cellulose biomaterial. PLoS One. 2018 Oct 24;13(10):e0205205. doi: 10.1371/journal.pone.0205205
  5. Weżgowiec J, Kulbacka J, Saczko J, Rossowska J, Chodaczek G, Kotulska M. Biological effects in photodynamic treatment combined with electropermeabilization in wild and drug resistant breast cancer cells. Bioelectrochemistry. 2018 Oct;123:9-18. doi:10.1016/j.bioelechem.2018.04.008
  6. Mikolajewicz K, Chodaczek G. Going deeper: three-dimensional study of γδ T cells in mouse reproductive tract using tissue clearing methods. Immunol. Cell Biol. 2018 Sep 14. doi.org/10.1111/imcb.12202.
  7. Zygmunt BM, Węgrzyn A, Gajska W, Yevsa T, Chodaczek G, Guzmán CA. Mannose Metabolism Is Essential for Th1 Cell Differentiation and IFN-γ Production. J Immunol. 2018 Jul 20. doi.org/10.4049/jimmunol.1700042
  8. Doskocz J, Drabik D, Chodaczek G, Przybyło M, Langner M. Statistical Analysis of Bending Rigidity Coefficient Determined Using Fluorescence-Based Flicker-Noise Spectroscopy. J Membr Biol. 2018 Jun 1. doi.org/10.1007/s00232-018-0037-8.
  9. Kupczyk P, Reich A, Gajda M, Hołysz M, Wysokińska E, Paprocka M, Nevozhay D, Chodaczek G, Jagodziński PP, Ziółkowski P, Szepietowski JC. UCHL1/PGP 9.5 Dynamic in Neuro-Immune-Cutaneous Milieu: Focusing on Axonal Nerve Terminals and Epidermal Keratinocytes in Psoriatic Itch. Biomed Res Int. 2018 Jul 25;2018:7489316. doi.org/10.1155/2018/7489316.
  10. Chodaczek G, Toporkiewicz M, Zal MA, Zal T (2018) Epidermal T Cell Dendrites Serve as Conduits for Bidirectional Trafficking of Granular Cargo. Front. Immunol. 2018 June 22;9:1430. doi.org/10.3389/fimmu.2018.01430.
  11. Orlowski P, Tomaszewska E, Ranoszek-Soliwoda K, Gniadek M, Labedz O, Malewski T, Nowakowska J, Chodaczek G, Celichowski G, Grobelny J, Krzyzowska M. Tannic acid-modified silver and gold nanoparticles as novel stimulators of dendritic cells activation. Front. Immunol. 2018 May 22;9:1115. doi.org/10.3389/fimmu.2018.01115.
  12. Christoffersson G, Chodaczek G, Ratliff SS, Coppieters K, von Herrath MG. Suppression of diabetes by accumulation of non-islet-specific CD8+ effector T cells in pancreatic islets. Sci Immunol. 2018 Mar 23;3(21). pii: eaam6533. doi: 10.1126/sciimmunol.aam6533.
  13. Borek A, Sokolowska-Wedzina A, Chodaczek G, Otlewski J. Generation of high-affinity, internalizing anti-FGFR2 single-chain variable antibody fragment fused with Fc for targeting gastrointestinal cancers. PLoS One. 2018 Feb 8;13(2):e019219.
  14. Suchanski J, Tejchman A, Zacharski M, Piotrowska A, Grzegrzolka J, Chodaczek G, Nowinska K, Rys J, Dziegiel P, Kieda C, Ugorski M. Podoplanin increases the migration of human fibroblasts and affects the endothelial cell network formation: A possible role for cancer-associated fibroblasts in breast cancer progression. PLoS One. 2017 Sep 22;12(9):e0184970.
  15. Sokolowska-Wedzina A, Chodaczek G, Chudzian J, Borek A, Zakrzewska M, Otlewski J. High-Affinity Internalizing Human scFv-Fc Antibody for Targeting FGFR1-overexpressing Lung Cancer. Mol Cancer Res. 2017 Aug;15(8):1040-1050.
  16. Bazylińska U, Pietkiewicz J, Rossowska J, Chodaczek G, Gamian A, Wilk KA. Polyelectrolyte Oil-Core Nanocarriers for Localized and Sustained Delivery of Daunorubicin to Colon Carcinoma MC38 Cells: The Case of Polysaccharide Multilayer Film in Relation to PEG-ylated Shell. Macromol Biosci. 2017 Jan 17. doi: 10.1002/mabi.201600356.
  17. Junka A, Fijałkowski K, Zabek A, Mikołajewicz K, Chodaczek G, Szymczyk P, Smutnicka D, Zywicka A, Sedghizadehf PP, Dziadas M, Młynarz P, Bartoszewicz M. Correlation between type of alkali rinsing, cytotoxicity of bio-nanocellulose and presence of metabolites within cellulose membranes. Carbohydr Polym. 2017; 157:371-379.
  18. Bzdzion L, Krezel H, Wrzeszcz K, Grzegorek I, Nowinska K, Chodaczek G, Swietnicki W. Design of small molecule inhibitors of type III secretion system ATPase EscN from enteropathogenic Escherichia coli. Acta Biochim Pol. 2017;64(1):49-63. doi: 10.18388/abp.2016_1265.
  19. Hanna RN, Chodaczek G, Hedrick CC. In vivo Imaging of Tumor and Immune Cell Interactions in the Lung. Bio Protoc. 2016 Oct 20;6(20). pii: e1973. doi: 10.21769/BioProtoc.1973.
  20. Drabik D, Przybyło M, Chodaczek G, Iglič A, Langner M. The modified fluorescence based vesicle fluctuation spectroscopy technique for determination of lipid bilayer bending properties. Biochim Biophys Acta. 2015 Nov 23;1858(2):244-252.
  21. Shaked I, Hanna RN, Shaked H, Chodaczek G, Nowyhed HN, Tweet G, Tacke R, Basat AB, Mikulski Z, Togher S, Miller J, Blatchley A, Salek-Ardakani S, Darvas M, Kaikkonen MU, Thomas GD, Lai-Wing-Sun S, Rezk A, Bar-Or A, Glass CK, Bandukwala H, Hedrick CC. Transcription factor Nr4a1 couples sympathetic and inflammatory cues in CNS-recruited macrophages to limit neuroinflammation. Nat Immunol. 2015; 16(12):1228-34.
  22. Hanna RN, Cekic C, Sag D, Tacke R, Thomas GD, Nowyhed H, Herrley E, Rasquinha N, McArdle S, Wu R, Peluso E, Metzger D, Ichinose H, Shaked I, Chodaczek G, Biswas SK, Hedrick CC. Patrolling monocytes control tumor metastasis to the lung. Science. 2015; 350(6263):985-90.
  23. McArdle S, Chodaczek G, Ray N, Ley K. Intravital live cell triggered imaging system reveals monocyte patrolling and macrophage migration in atherosclerotic arteries. J Biomed Opt. 2015; 20(2):26005.
  24. Mikulski Z, Johnson R, Shaked I, Kim G, Nowyhed H, Goodman W, Chodaczek G, Pizarro TT, Cominelli F, Ley K. SAMP1/YitFc mice develop ileitis via loss of CCL21 and defects in dendritic cell migration. Gastroenterology 2015; 148(4):783-793.e5.
  25. Vicente-Suarez I, Larange A, Reardon C, Matho M, Feau S, Chodaczek G, Park Y, Obata Y, Gold R, Wang-Zhu Y, Lena C, Zajonc DM, Schoenberger SP, Kronenberg M, Cheroutre H. Unique lamina propria stromal cells imprint the functional phenotype of mucosal dendritic cells. Mucosal Immunol. 2015; 8(1):141-51.
  26. Verma S, Wang Q, Chodaczek G, Benedict CA. Lymphoid tissue stromal cells coordinate innate defense to cytomegalovirus. J Virol. 2013; 87(11):6201-10.
  27. Ariotti S, Beltman JB, Chodaczek G, Hoekstra ME, van Beek AE, Gomez-Eerland R, Ritsma L, van Rheenen J, Marée AF, Zal T, de Boer RJ, Haanen JB, Schumacher TN. Tissue-resident memory CD8+ T cells continuously patrol skin epithelia to quickly recognize local antigen. Proc Natl Acad Sci USA. 2012; 109(48):19739-44.
  28. Koltsova EK, Garcia Z, Chodaczek G, Landau M, McArdle S, Scott SR, von Vietinghoff S, Galkina E, Miller YI, Acton ST, Ley K. Dynamic T cell-APC interactions sustain chronic inflammation in atherosclerosis. J Clin Invest. 2012; 122(9):3114-26.
  29. Chodaczek G, Papanna V, Zal MA, Zal T. Body-barrier surveillance by epidermal γδ Nat Immunol. 2012; 13(3):272-82.
  30. Zal T, Chodaczek G. Intravital imaging of anti-tumor immune response and the tumor microenvironment. Semin Immunopathol. 2010; 32(3):305-17.
  31. Chodaczek G, Bacsi A, Dharajiya N, Sur S, Hazra TK, Boldogh I. Ragweed pollen-mediated IgE-independent release of biogenic amines from mast cells via induction of mitochondrial dysfunction. Mol Immunol. 2009; 46(13):2505-14.
  32. Chodaczek G, Zimecki M, Lukasiewicz J, Lugowski C. Lactoferrin-monophosphoryl lipid a complex enhances immunity of mice to Plesiomonas shigelloides CNCTC 138/92. Acta Biochim Pol. 2008; 55(1):91-6.
  33. Bacsi A, Chodaczek G, Hazra TK, Konkel D, Boldogh I. Increased ROS generation in subsets of OGG1 knockout fibroblast cells. Mech Ageing Dev. 2007; 128(11-12):637-49.
  34. Zimecki M, Kocieba M, Chodaczek G, Houszka M, Kruzel M. Lactoferrin Ameliorates Clinical Symptoms of Experimental Encephalomyelitis in Lewis Rats. J Neuroimmunol, 2007; 182(1-2):160-6
  35. Chodaczek G, Zimecki M, Lukasiewicz J, Lugowski C. A complex of lactoferrin with monophosphoryl lipid A is an efficient adjuvant of the humoral and cellular immune response in mice. Med Microbiol Immunol (Berl). 2006; 195(4):207-16.

Książki:

McArdle S, Koltsova E, Chodaczek G, Ley K. Live Cell Multiphoton Microscopy of Atherosclerotic Plaques in Mouse Aortas. In: Cardiovascular Imaging. Arterial and Aortic Valve Inflammation and Calcification, Springer International Publishing, 2014, pp 155-170,

OPUS 8: Konstytutywna autoreaktywność komórek T gamma-delta jako korzystny mechanizm kontroli bariery naskórka
Kierownik projektu: Grzegorz Chodaczek, Narodowe Centrum Nauki, okres finansowania: 2015-2019

SONATA BIS 4: Wieloparametryczna charakterystyka kontroli homeostazy nabłonka układu rozrodczego przez komórki T gamma-delta z uwzględnieniem wysokorozdzielczej mikroskopii przyżyciowej
Kierownik projektu: Grzegorz Chodaczek, Narodowe Centrum Nauki, okres finansowania: 2015-2020,

2014-04-04 exp130-1 2014-05-07 exp269 2015-01-12 citral m4 RGB(1) 2015-06-25 exp2578 Surface_Plot_of_C1-Experiment-1300 HandE 20x_c1+2+3 e82 hpo RGB 2015-01-08 gent 128ug

Print Friendly, PDF & Email
Autor: PORT - Polski Ośrodek Rozwoju Technologii, Opublikowano: 11.02.2015
plusfontminusfontreloadfont